据阿克苏、巴楚等地一些棉企反映，10月下旬以来交储竞拍异常困难，柯坪某厂自10月中旬拍上一个280吨合同后，至11月11日已近1个月没有再拍上；而“入库”难的问题再次显现，特别是巴楚兵团、阿克苏兵团等库因入储量大，装卸能力受限及初检、复验时间长等原因，不少棉企的合同被推迟到1周以后。
　　业内分析，一方面是南疆入储库容同棉花产量、交储量不配套（除库尔勒地区因直属、代储库多，库容达到100多万吨外），特别是阿克苏、喀什地区不仅仓库少、产量大，而且2011、2012年度仓库陈棉运出疆量较低，造成可入库量有限；另一方面大量内地、新疆骨干企业或代拍企业存在，几十个卡逐一拍阿克苏或巴楚等地仓库。
　　一些轧花表示，厂内已存有500-800吨皮棉，如果11月下旬前仍无法拍上合同，只能通达大单交储企业交储或想办法请人代拍，否则占压资金、银行利息等都较高。
　　11月上旬以来，阿克苏西大桥、柯坪和巴楚等地已有少数轧花厂提前停止籽棉收购，至11月15日前预计加工结束。主要原因是由于9月上旬至10月下旬籽棉收购价偏高，皮棉综合生产成本已贴近国家收储价格，而11月上旬虽籽棉品级下滑、衣分下降但收购价下跌不明显；再加上部分棉企担心交储回款期过长，资金压力大，而轧花厂为自已经营，不存在“保底”量的说法，因此在“收购无法放量，交储又有一定亏损”的情况下提前结束收购和加工。
　　巴楚某厂表示，截止11月10日共收购12000吨籽棉（2条生产线），籽棉平均收购价9.58元/公斤（约41.6%的衣分），籽棉收购价高于去年0.53元/公斤，而目前棉籽销售价仅在2.12-2.15元/公斤（厂内提货），一旦后市棉籽价格补跌或公检二级白棉的比例下滑，即使交储成功亏损也再所难免。