为进一步帮助解决新疆生产棉花、棉纱、棉布远离内地销区导致运输成本较高问题，促进新疆棉花和纺织产业发展，根据财政部《关于调整出疆棉运费补贴政策执行方式的通知》（财建[2012]1106号）精神，自2013预算年度起，中央财政支持新疆生产棉花、棉纱、棉布运往内地销区的运输费用补贴审核和拨付工作由新疆财政厅承担，并确定通过公路运输出疆的新疆生产棉花给予同等标准的费用补贴。2013年3月11日，新疆自治区财政厅对外发布《关于印发《出疆棉运费补贴操作细则》的通知》（新财建〔2013〕42号）和《关于做好2012年度出疆棉花运费补贴申报工作的通知》（新财建〔2013〕43号），正式公布出疆棉运费补贴审核细则以及2012年度出疆棉运费补贴申报、审核及相关工作的操作流程。
　　经过十多年的发展，全国棉花交易市场已经建立起棉花交易、物流监管、资金、信息等四大服务平台，并相应构建起客户服务、棉花第三方监管、业务运营和风险防控、技术等四大业务保障体系，在国内棉花行业乃至国际棉花界建立了良好的信誉和广泛的影响力。在充分考虑全国棉花交易市场的申报平台、监管平台、信息平台以及技术开发、支持和保障等方面优势的基础上，新疆财政厅本着“便捷、高效、安全”的原则，决定委托全国棉花交易市场（以下简称“交易市场”）协助做好运费补贴的相关工作。3月1日，双方在乌鲁木齐市签订有关合作协议。
　　根据合作协议，新疆财政厅授权全国棉花交易市场建立出疆棉铁路、公路运费补贴网上申报系统和数据库，负责符合条件的申报企业有关网上申报电子材料的接收、汇总；授权交易市场在中国棉花信息网上设立专栏，负责运费补贴申报相关信息以及新疆财政厅有关政策规定等的发布工作；授权交易市场在新疆和内地符合出疆棉公路运输流向的合适地点设置公路出疆棉现场核查点，以及利用交易市场现有合作的指定交割（监管）仓库，按照交易市场已有成熟的监管模式和双方事先商定的流程，对通过公路运输出疆并申请运费补贴的新疆棉实施规范监管，以确保申请企业申报的公路运输出疆棉的真实性和准确性。据悉，全国棉花交易市场在新疆大河沿和甘肃天水分别设置的新疆和内地出疆棉现场核查点正在抓紧做好各项核查准备工作，确保3月15日以后通过公路运输出疆的新疆棉能够顺利接受现场核查并申请运费补贴。
　　新疆财政厅委托全国棉花交易市场参与出疆棉花等的申报和监管等相关工作，这是对全国棉花交易市场的充分信任和殷切期望。全国棉花交易市场将秉持公平、公正、规范的原则，确保申报和监管的真实性，为促进新疆棉花产业健康发展做出应有的贡献。